疟原虫为按蚊传播的孢子虫，是疟疾（malaria）的病原体。寄生于人体的疟原虫有四种，即间日疟原虫、三日疟原虫、恶性疟原虫和卵形疟原虫。

疟原虫其实是动物名。原生动物门孢子虫纲血孢子虫目。是引起疟疾的病原体。疟原虫以疟蚊为媒介，它会随着蚊子的唾液进入人体肝细胞内繁殖，而後侵入红血球中加以破坏，摄食养料来破坏红血球。患者会时而发冷时而发热，同时，病发时间因疟原虫的种类而异。有四种疟原虫常见寄生於人体中：间日疟原虫、恶性疟原虫、三日疟原虫、卵形疟虫。 也称为「疟虫」。

疟原虫的基本结构包括核、胞质和胞膜，环状体以后各期尚有消化分解血红蛋白后的最终产物—疟色素。血片经姬氏或瑞氏染液染色后，核呈紫红色，胞质为天蓝至深蓝色，疟色素呈棕黄色、棕褐色或黑褐色。四种人体疟原虫的基本结构相同，但发育各期的形态又各有不同，可资鉴别。除了疟原虫本身的形态特征不同之外，被寄生的红细胞在形态上也可发生变化。被寄生红细胞的形态有无变化以及变化的特点，对鉴别疟原虫种类很有帮助。