苦瓜本身具有很多的作用，首先苦瓜中含有苦瓜甙和苦味素，这些可以增进人的食欲，健脾开胃，另外苦瓜中含有的生物碱类物质奎宁，具有利尿活血，退热消炎 明目清心的功效。其次苦瓜还可以防癌抗癌，苦瓜中的蛋白质和大量维生素C可以有效提高人体的免疫功能，让免疫细胞更加强大，对于对抗癌细胞起到显著作用，机体在对抗癌细胞时往往依靠其吞噬能力，而苦瓜对于吞噬能力具有一定增强作用，在医学领域常用于治疗淋巴肉瘤和白血病，苦瓜籽中还可以提炼出胰蛋白酶抑制剂，这是一种可以抑制癌细胞分泌的蛋白酶，可以起到阻止恶性肿瘤生长的作用。最后，苦瓜的新鲜汁液还具有显著的降血糖作用，十分适合糖尿病患者食用。

苦瓜虽好，也不适合一次性食用过量，苦瓜煮水用来擦洗皮肤，也可以清热止痒祛痱，苦瓜与鸡蛋一同食用，还可以很好的保护骨骼，牙齿和血管，有利于机体更好的吸收铁质，达到健胃的效果，治疗胃痛，感冒和小儿腹泻。

苦瓜中含有较多草酸，草酸容易与钙结合，影响钙吸收，所以苦瓜不宜长期大量食用，同样的由于苦瓜的降血糖功能，苦瓜也不适宜患低血糖人群大量食用。苦瓜熟食性温生食性寒，应注意食用。